まず最初に「HTML編集App」をお使いになっていないかをご確認ください。
「HTML編集App」を使って購入したテーマの内容を1文字でも変更した場合は、いくらこちらでアップデート申請してもショップ側でテーマの自動更新が反映されません。もし編集している場合でも再度「テーマ設定」から購入したテーマを選択し直して最新バージョンを反映させることは可能ですが、編集した内容は上書きされて消えてしまいますのでご注意ください。
また「HTML編集App」以外の他の原因として、BASE側のアップデートが反映されるまでに時間がかかっている場合がございます。テーマ購入画面に「最終更新日 」が記載されていますが、直近のアップデートが「最終更新日」に近い場合は反映されるまで多少お時間がかかる場合があります。
どちらにも該当しない場合はお手数ですがBASEにお問い合わせいただき、事情をお伝えいただきます様にお願いいたします。